고대 DNA 재

Scientific Reports 13권, 기사 번호: 13635(2023) 이 기사 인용

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고생물학은 멸종된 종의 계통발생학을 포함한 여러 분야에 관련 영향을 미치면서 전례 없는 해상도로 많은 주요 진화 사건에 대한 우리의 이해를 개선하는 데 기여하고 있습니다. 지금까지 지중해 지역의 현존 및 멸종 동물 종은 DNA 수준에서 특성이 밝혀진 바가 거의 없습니다. 사르디니아토끼, Prolagus sardus (Wagner, 1829)는 사르디니아와 코르시카에 서식하다가 홀로세 동안 멸종된 대표적인 토끼류 종이었습니다. 멸종된 Prolagus 속을 Ochotonidae과(Lagomorpha목의 현존하는 두 과 중 하나) 또는 분리된 Prolagidae과, 또는 Ochotonidae과 내의 Prolaginae아과에 대한 계통발생학적 할당에 대한 특정 과학적 논쟁이 있습니다. 이 연구에서 우리는 신석기 시대의 사르디니아 피카의 미토겐놈 일부를 성공적으로 재구성하고 사르디니아의 고고학 유적지인 카바다리스 동굴에서 회수했습니다. 우리의 보정된 계통발생은 Prolagus속이 약 3천만년 전에 Ochotona속 계통에서 갈라진 Ochotonidae과의 독립적인 자매 그룹이라는 가설을 뒷받침할 수 있습니다. 이러한 결과는 고생물학 연구에서 이미 설명한 Prolagus 속의 형태학적 특성에 대한 계통발생학적 해석을 개선하는 데 기여할 수 있습니다.

멸종된 동물 종의 고대 DNA(aDNA)에 대한 연구를 통해 과거를 파헤치고 고전 고생물학 접근법을 보완하여 전례 없는 수준으로 진화 궤적을 재구성할 수 있게 되었습니다1,2,3,4,5,6. 특히, 미토콘드리아 DNA(mtDNA)는 핵 게놈과 관련하여 고대 유적에 풍부하고, 높은 돌연변이율 및 거의 중립적인 진화 모드로 인해 계통발생과 인구 역학을 이해하는 데 유용한 도구를 나타냅니다. 12.

지중해 지역의 몇몇 멸종된 동물 종은 지금까지 DNA 수준에서 특성화되었으며, 고립되고 고유한 종3,4,7,13,14,15,16의 독특한 진화 역사에 대한 정보를 제공합니다. 흥미로운 사례 연구는 사르데냐의 멸종된 종을 기반으로 합니다. 수수께끼의 멸종된 사르디니아 돌(Cynotherium sardous Studiati, 1857)과 관련된 고생물학 데이터는 후기 홍적세 말까지 이 섬에 서식했던 이 독특한 갯과 종이 다른 모든 살아있는 갯과 동물과 별개의 분류군을 나타내며 유전적으로 다른 갯과 동물과 분리되었음을 보여주었습니다. 본토 개과 계통은 약 500~300kya(중기 홍적세)4입니다.

사르데냐와 코르시카에 서식했던 또 다른 수수께끼의 상징적인 멸종종은 사르디니아새끼(Prolagus sardus)입니다(Wagner, 1829)17,18,19. Lagomorpha 목에 속하는 Prolagus Pomel 속(1853)은 신생대와 제4기 동안 살았던 여러 종에 의해 기록됩니다19,20,21. 이 속에 속하는 화석은 유럽, 북아프리카, 아나톨리아의 여러 지역에서 확인되었습니다. Prolagus의 진화 역사와 해부학은 전통적으로 이 속을 Ochotonidae Thomas과의 독특한 구성원으로 간주했던 여러 저자에 의해 논의되었습니다, 189720,21,22,23,24,25,26,27,28,29, 현재 살아있는 새토끼만 포함되며 모두 Ochotona Link 속(1795)으로 분류됩니다. 그러나 몇몇 다른 저자들은 모든 멸종된 Prolagus 종이 Prolagidae Gureev(1964)에 속하거나 Ochotonidae의 아과인 Prolaginae에 속한다고 제안했습니다. ,24,25,26,27,28. 세 번째 하부 어금니(M3)가 없다는 점은 Prolagus 종을 Ochotona 속과 구별하는 주요 해부학적 요소 중 하나입니다. Prolagus는 단일특이성 Piezodus Viret 속(1929)에서 유래된 것으로 생각됩니다. 이 분류군은 유럽 올리고세-하중신세의 분류군입니다. 이 종은 뿌리가 있는 뺨 치아와 메타플렉시드가 존재하고 제3기에는 프로토콘눌리드가 없다는 점에서 Prolagus와 다릅니다. 하부 소구치20,21,31,32. 프롤라구스 종은 가르가노 고군도(후기 중신세? – 초기 플라이오세)와 사르디니아-코르시카 블록(후기 플라이오세 – 홀로세)에서 검색된 분류군에 기록된 바와 같이 지중해 섬 환경에 존재하는 것으로 알려져 있습니다. 코르시카와 사르디니아에서 Prolagus 속은 세 가지 고유 분류군인 Prolagus aff를 포함하는 분석 계통으로 표시됩니다. figaro(Capo Mannu D1의 초기 후기 Pliocene), Prolagus figaro López-Martínez, 1975(최신 Pliocene?/초기 홍적세—후기 초기 홍적세) 및 Prolagus sardus(Wagner, 1829)(Middle Pleistocene—Holocene)17,20,32, 33,34,35,36.